Présentation
Dans la lutte contre les maladies transmissibles, il est important de comprendre comment les agents infectieux se propagent dans la population pour évaluer l’impact des épidémies qu’ils génèrent, anticiper leur évolution ainsi que l’efficacité des mesures de contrôle. Les modèles mathématiques sont un outil utile pour décrire ces dynamiques épidémiques complexes et multifactorielles, et interpréter des données épidémiologiques souvent limitées. Depuis le début de la pandémie de COVID-19, l’Unité de Modélisation Mathématique des Maladies Infectieuses de l’Institut Pasteur a utilisé ces approches pour étudier la diffusion du virus SARS-CoV-2. Ces analyses permettent par exemple d’estimer les risques associés à l’infection SARS-CoV-2, d’évaluer l’impact des mesures de contrôle, de suivre la diffusion du virus SARS-CoV-2, en estimant par exemple la proportion de la population ayant été infectée par le SARS-CoV-2, de produire de projections pour anticiper sur le court terme les besoins hospitaliers des patients Covid-19, de déterminer l’impact des variants et de la vaccination sur la dynamique de l’épidémie et d'estimer le niveau de couverture vaccinale permettant le retour à une vie normale.
Dans cet espace, nous revenons sur les différents travaux réalisés par l’équipe depuis le commencement de la pandémie.
Ces travaux sont réalisés en collaboration avec des collègues de Santé publique France (Daniel Lévy-Bruhl, Yann Le Strat, Alexandra Mailles, Jean-Claude Désenclos, Patrick Rolland, Fanny Chéreau), l’Institut Pasteur (Lulla Opatowski, Arnaud Fontanet), l’EHESP (Pascal Crépey), l’INSERM (Pierre-Yves Boëlle, Fabrice Carrat, Nathanaël Lapidus, Vittoria Colizza, Chiara Poletto, Bruno Lina, Yazdan Yazdanpanah, Xavier de Lamballerie), la Haute Autorité de Santé (Laura Zanetti), la DREES (Noémie Courtejoie), l’Université de Cambridge (Henrik Salje, Noémie Lefrancq, Megan O’Driscoll, Lin Wang, Gabriel Ribeiro Dos Santos), l’APHP (Lila Bouadma), l’INRIA (Marc Lavielle), PREDICT Services (Alix Roumagnac), le Collège de France (François Blanquart), CNRS (Florence Débarre), le Hub Bioinformatique et Biostatistique de l’Institut Pasteur (Rachel Torchet, Hervé Ménager et Rémi Planel), et la Direction des Systèmes d'Information de l'Institut Pasteur (Thomas Ménard).
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